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Le 5 juin, Shimadzu Corporation lancera LabSolutions Insight Biologics, un logiciel de caractérisation des oligonucléotides pour les spectromètres de masse à temps de vol quadripolaire (Q-TOF) à chromatographie liquide haute performance LCMS-9030 et LCMS-9050. Ce logiciel effectue automatiquement à la fois la mesure et l'analyse lors de la caractérisation des oligonucléotides, réduisant le temps d'analyse à 1/10 ou moins par rapport aux pratiques conventionnelles. Équipé de fonctions telles que l'affichage des formules structurales des molécules, des méthodes de calcul suggérées pour les ratios de composants et une technologie d'estimation des impuretés (brevet en instance), le logiciel contribue à accroître l'efficacité de la recherche thérapeutique basée sur les acides nucléiques.

Photo : Fenêtre du logiciel LabSolutions Insight Biologics

Les produits thérapeutiques à base d’acide nucléique sont un type de produits biopharmaceutiques constitués d’ADN et d’ARN. Ils ont des effets secondaires minimes et devraient être applicables aux maladies difficiles à traiter. Ils sont considérés comme « le troisième type de produits pharmaceutiques prometteurs » après les produits pharmaceutiques à petites molécules et les produits pharmaceutiques à base d’anticorps. Les oligonucléotides, qui sont les ingrédients pharmaceutiques des produits thérapeutiques à base d’acide nucléique, sont généralement formés par synthèse chimique. Cependant, des impuretés non intentionnelles peuvent être produites au cours du processus. Des confirmations et des évaluations de sécurité sont nécessaires, mais comme les poids moléculaires des principaux composants sont similaires, des mesures de poids précises sont nécessaires, ce qui rend la caractérisation difficile.

LabSolutions Insight Biologics a été développé sur la base des résultats d'une recherche collaborative avec PeptiStar Inc., une organisation de développement et de fabrication sous contrat (CDMO) pour les ingrédients pharmaceutiques peptidiques ^*1 et thérapeutiques à base d'acides nucléiques. Lors de l'évaluation du processus de caractérisation, des échantillons imitant les produits thérapeutiques à base d'acides nucléiques fournis par PeptiStar ont été utilisés, ce qui a permis d'obtenir une caractérisation très précise. Le logiciel a été rendu convivial en le développant sur la base du flux de travail réel requis pour cette recherche, de la recherche et du développement à la fabrication des ingrédients pharmaceutiques et à la confirmation des impuretés.

Caractéristiques

1. Caractérisation des oligonucléotides lisses

La recherche d'impuretés produites lors de la synthèse d'oligonucléotides demande beaucoup de temps et de travail. Shimadzu a développé un flux de travail de caractérisation simple et rapide en utilisant les données issues de la recherche collaborative avec PeptiStar. Une recherche complète des principaux composants et de leurs impuretés associées est effectuée automatiquement par les spectres MS et MS/MS ^*2, réduisant le temps nécessaire à la caractérisation à 1/10 ou moins de la quantité conventionnelle requise.

2. Un flux de travail simple pour tous

Grâce à nos fonctions logicielles propriétaires, le flux de travail est facile à suivre pour tout opérateur. Normalement, la séquence nucléotidique des principaux composants doit être saisie avant la mesure de la séquence oligonucléotidique, ce qui est une étape compliquée et sujette aux erreurs. Cependant, avec une fonction qui affiche les informations de séquence nucléotidique sous forme de formule structurale en temps réel, les principaux composants enregistrés peuvent être vérifiés visuellement. De plus, le logiciel est équipé d'une fonction permettant de basculer l'affichage entre le mode complet (figure ci-dessous à gauche) pour vérifier l'exactitude de la séquence de bases ^*3, et le mode ramifié (figure ci-dessous à droite) pour vérifier les positions où les impuretés ont tendance à être produites. En vérifiant les résultats avec ces deux modes, la séquence estimée peut être évaluée plus précisément.

3. Estimation des séquences de bases nécessaires à l'identification des impuretés

Lors de l'identification d'analogues d'acides oligonucléotidiques, la recherche d'impuretés ayant des poids moléculaires et des séquences de bases similaires est une tâche difficile et compliquée. Ce logiciel utilise notre méthode exclusive de spectre de fragments (brevet en instance) pour estimer les séquences de bases avec une grande précision, même parmi de nombreuses molécules similaires. La consolidation efficace de plusieurs spectres MS/MS simplifie les vérifications des informations spectrales et limite l'impact de la variabilité dans chaque mesure.

• *1 : Il s'agit de médicaments dont les principaux composants sont des peptides constitués de 2 à 50 acides aminés liés. Ils se caractérisent par un large spectre d'action et moins d'effets secondaires.
• *2 : Ces données sont obtenues à partir des résultats de la spectrométrie de masse. La masse est représentée sur l'axe vertical et l'intensité de détection est représentée sur l'axe horizontal. Elles contiennent de nombreuses informations sur le poids moléculaire des principaux composants et des résidus.
• *3 : Il s'agit des unités de configuration des oligonucléotides. Elles sont constituées de quatre types. La séquence doit être vérifiée pour identifier les impuretés.

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LabSolutions Insight Produits biologiques